More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0548 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 217 aa  446  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  446  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  51.96 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  48.83 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  44.39 
 
 		 255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  42.22 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  33.66 
 
 		 246 aa  134  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  32.76 
 
 		 246 aa  108  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.51 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  35.2 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  34.76 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  33.81 
 
 		 245 aa  98.2  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  31.12 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  32.52 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  33.77 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.3 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  30.77 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  28.7 
 
 		 269 aa  95.1  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  30.42 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.6 
 
 		 251 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  37.96 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.57 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  34.95 
 
 		 293 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 		 258 aa  91.7  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  30.49 
 
 		 273 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.94 
 
 		 247 aa  88.6  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  34.01 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  28.94 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  29.06 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  31.32 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  39.66 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  31.92 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.93 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.93 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 242 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  28.27 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.37 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  28.69 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.48 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  28.22 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  32.24 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  28.34 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  27.48 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  30.82 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  32.92 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.82 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  27.8 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  26.58 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  29.7 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  28.38 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.63 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30.81 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  27.39 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  26.27 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  28.27 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  33.54 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  31.54 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  28.89 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  31.13 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.22 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.69 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  30.67 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  31.13 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.2 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  26.67 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  38.32 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  29.59 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  28.4 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  37.38 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  32.94 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  29.08 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  35.51 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  26.98 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>