276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3749 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  59.66 
 
 		 227 aa  271  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  57.08 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  57.51 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  57.56 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  54.51 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  50.43 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  48.5 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  48.07 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  48.07 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  48.07 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  47.64 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  47.21 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  47.21 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  46.78 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  46.78 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  46.78 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  46.78 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  46.35 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  46.35 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  46.35 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  37.23 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  40.53 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  37 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  35.14 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  34.68 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  35.37 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  35.21 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  36.36 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.64 
 
 		 180 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  35.37 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  35.02 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  33.7 
 
 		 185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  31.9 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  36.91 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  34.42 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  34.68 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  36.12 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  32.46 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.89 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  34.18 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.92 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  34.8 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  34.36 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  34.8 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  35.24 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  30.88 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  34.36 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  30.67 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  33.92 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  31.6 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  35.24 
 
 		 263 aa  101  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  34.36 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.19 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.53 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  33.8 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  33.33 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  34.8 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  33.33 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  34.78 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  32.48 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  33.67 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  37.33 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  35.16 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  35.24 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.95 
 
 		 261 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  32.76 
 
 		 279 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.36 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  34.74 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  32.38 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  35.35 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  29.96 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  27.51 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  33.03 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  28.89 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  34.2 
 
 		 293 aa  92.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.19 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  33.04 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  30.13 
 
 		 274 aa  92  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  30.62 
 
 		 262 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>