More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4633 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  58.8 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  59.66 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  61.34 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  60.52 
 
 		 233 aa  257  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  58.15 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  55.51 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  55.51 
 
 		 227 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  55.07 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  55.51 
 
 		 227 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  55.51 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  55.07 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  55.07 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  55.07 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  54.63 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  55.07 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  55.07 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  55.07 
 
 		 227 aa  234  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  54.63 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  54.63 
 
 		 227 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  59.23 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  59.23 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  59.23 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  38.5 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  43.2 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  42.79 
 
 		 286 aa  148  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  39.21 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  40.71 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  38.05 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  39.73 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 185 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  38.1 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  40.58 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  39.27 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.43 
 
 		 243 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  41.06 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  42.51 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  34.08 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  38.29 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  39.78 
 
 		 180 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  33.64 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  36.64 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  40.91 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  33.03 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  34.08 
 
 		 274 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  33.33 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  36.94 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  35.78 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  40.72 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.19 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  34.21 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.1 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  37.69 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  34.82 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  34.38 
 
 		 263 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  37.17 
 
 		 262 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  34.82 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  38.86 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  34.82 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  34.38 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  34.38 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  33.93 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  39.3 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  36.77 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  34.38 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  32.87 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  36.09 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  36.79 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  32.27 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2767  phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  36.21 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  36.18 
 
 		 262 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  34.34 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2905  phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  35.56 
 
 		 250 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.82 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  32.37 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  36.36 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  39.07 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  37.91 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  37.17 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  32.84 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.36 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  38.8 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>