299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3826 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  100 
 
 
227 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  69.16 
 
 
227 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  69.16 
 
 
227 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  68.72 
 
 
227 aa  298  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  69.16 
 
 
227 aa  298  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  67.84 
 
 
227 aa  294  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  67.84 
 
 
227 aa  291  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  67.84 
 
 
227 aa  291  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  67.84 
 
 
227 aa  291  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  67.4 
 
 
227 aa  290  9e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  67.4 
 
 
248 aa  290  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  67.4 
 
 
227 aa  288  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  67.4 
 
 
227 aa  288  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  67.4 
 
 
227 aa  288  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  67.4 
 
 
227 aa  287  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  58.15 
 
 
227 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  49.36 
 
 
233 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  49.79 
 
 
233 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  52.94 
 
 
239 aa  215  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  53.22 
 
 
233 aa  215  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  50.43 
 
 
233 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  50.43 
 
 
233 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  50.43 
 
 
233 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  43.18 
 
 
286 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  38.05 
 
 
232 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  40.27 
 
 
230 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  38.84 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  39.01 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  37.61 
 
 
266 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  39.13 
 
 
241 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
180 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 
239 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  40.95 
 
 
241 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  35.4 
 
 
243 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
244 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
185 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  38.91 
 
 
246 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.23 
 
 
243 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  38.12 
 
 
237 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  37.62 
 
 
244 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  37.93 
 
 
268 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  31.71 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
226 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  38.53 
 
 
259 aa  118  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.16 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  32.16 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  32.16 
 
 
234 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  35.71 
 
 
245 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  34.98 
 
 
262 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
239 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  35.93 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  33.78 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  35.62 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  34.22 
 
 
268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  35.68 
 
 
235 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  33.93 
 
 
242 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  36.73 
 
 
263 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  36.28 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  36.28 
 
 
263 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  34.22 
 
 
262 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.89 
 
 
251 aa  111  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.43 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  35.84 
 
 
263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
247 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  31.84 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  32.14 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  35.67 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2767  phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 
270 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  32.31 
 
 
252 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 
279 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 
261 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.77 
 
 
243 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  36.05 
 
 
261 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  41.57 
 
 
240 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.07 
 
 
238 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  35.96 
 
 
299 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
247 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  35.5 
 
 
255 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2905  phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 
270 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0669  ComF family protein  36.05 
 
 
255 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  35.85 
 
 
267 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0504  putative competence protein  36.05 
 
 
255 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  33.33 
 
 
262 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  37.09 
 
 
245 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0486  putative competence protein  36.05 
 
 
255 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  33.78 
 
 
250 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0173  ComF family protein  36.05 
 
 
255 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3200  ComF family protein  36.05 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1419  ComF family protein  36.05 
 
 
255 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.18 
 
 
230 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2846  ComF family protein  36.05 
 
 
255 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 
217 aa  99.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  32.33 
 
 
227 aa  99  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
220 aa  99  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>