278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0367 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  49.18 
 
 
262 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  49.58 
 
 
262 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  49.58 
 
 
262 aa  240  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
270 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  47.62 
 
 
236 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  42.62 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  44.3 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  44.08 
 
 
255 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  45 
 
 
270 aa  208  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  45.92 
 
 
255 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  42.62 
 
 
271 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
264 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  43.27 
 
 
255 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  46.35 
 
 
272 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 
268 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  45.49 
 
 
267 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
258 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  44.73 
 
 
258 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
255 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  45.87 
 
 
269 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  43.72 
 
 
253 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
254 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
264 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  43.7 
 
 
279 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 
255 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 
248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  32.92 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  34.03 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
246 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 
259 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  33.76 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  34.03 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.49 
 
 
240 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  38.84 
 
 
239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.39 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  35.55 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
239 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  32.79 
 
 
245 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.33 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  31.8 
 
 
258 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 
260 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.58 
 
 
230 aa  118  9e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  29.46 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  33.89 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  29.49 
 
 
227 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  32.59 
 
 
299 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  29.76 
 
 
243 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  32.3 
 
 
233 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  33.64 
 
 
227 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  32.08 
 
 
251 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
247 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30.9 
 
 
233 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  31.76 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  34.58 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  30.34 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  32.91 
 
 
237 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  29.8 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.51 
 
 
233 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.77 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  30.77 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.05 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.25 
 
 
296 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  29.88 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  29.32 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  25.83 
 
 
234 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  29.39 
 
 
244 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  29.19 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  25.83 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  29.58 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  28.87 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  28.66 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.26 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 
246 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  26.05 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  28.12 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  29.39 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  28.35 
 
 
247 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
247 aa  85.5  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  29.57 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
213 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  27.16 
 
 
226 aa  85.5  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  30.04 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  30.3 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>