157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0775 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  463  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  463  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  55.56 
 
 
224 aa  250  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
224 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  30.47 
 
 
234 aa  101  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  30.64 
 
 
234 aa  99  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  28.76 
 
 
234 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.33 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  32.38 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  28.57 
 
 
234 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  27.9 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  29.41 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  29.61 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  29.17 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  31.54 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  31.54 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  27.49 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  31.84 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  31.88 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  25 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  27.46 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.52 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  26.42 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  32.26 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 
245 aa  62  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  29.94 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  24.15 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  24.4 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.1 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  25.82 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.48 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  25.91 
 
 
240 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  25.69 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  25.67 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  31.17 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  26.18 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 
276 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  26.38 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  26.27 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  30.12 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  30.12 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  27.39 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  21.36 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 
268 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  22.02 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  23.98 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  28.93 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  25.37 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.77 
 
 
258 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  24.53 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.77 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.76 
 
 
250 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.68 
 
 
246 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  30.66 
 
 
208 aa  52  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  26.88 
 
 
226 aa  51.6  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  23.9 
 
 
228 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  25.77 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  26.07 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  25.4 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  23.83 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  25.52 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  20.32 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  26.17 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  26.14 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  23.96 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  27.7 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  24.41 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  27.74 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  27.55 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  25 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  26.94 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  22.93 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  24.35 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  21.74 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  24.14 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  21.66 
 
 
247 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  22.55 
 
 
233 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  24.65 
 
 
254 aa  48.5  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  23.15 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  22.93 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  22.94 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  22.29 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>