271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5299 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  100 
 
 
234 aa  487  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  85.47 
 
 
234 aa  420  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  85.9 
 
 
234 aa  421  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  85.04 
 
 
234 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  99.47 
 
 
190 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  73.93 
 
 
234 aa  371  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  84.21 
 
 
190 aa  333  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  84.21 
 
 
190 aa  333  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  61.97 
 
 
234 aa  315  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  77.89 
 
 
190 aa  310  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  76.84 
 
 
190 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  41.95 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  41.95 
 
 
235 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
226 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  33.19 
 
 
220 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  33.47 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.96 
 
 
226 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
259 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  30.04 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.23 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  29.41 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  28.88 
 
 
224 aa  82  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  26.86 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  26.76 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  31.05 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  27.98 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  27.93 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  26.76 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  27.68 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  28.88 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  28.84 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  28.77 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  28.87 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  32.91 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  29.36 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  28.5 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  24.43 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.2 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  29.91 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  27.59 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  26.7 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  25.58 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  27.59 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  27.72 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  29.81 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.85 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  27.16 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.54 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  27.42 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  27.16 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  35.88 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  26.05 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.31 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  28.77 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  25.46 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  24.66 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  35.9 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  26.72 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  35.9 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  27.47 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  35.9 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  35.9 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  35.9 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  27.16 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  26.94 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.19 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  27.9 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.64 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  25.41 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.67 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  26.51 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  25.91 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  25.46 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  26.51 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  26.51 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  35.04 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.45 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  32.47 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>