205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1189 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  44.5 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  42.73 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.73 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  35.96 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  33.19 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  34.23 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  36.32 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  33.19 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  33.05 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  32.33 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  33.19 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  31.03 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  30.34 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  36.57 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  36.57 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  33.87 
 
 		 190 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  34.68 
 
 		 190 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  35.26 
 
 		 190 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  33.33 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  30.9 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  30.9 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  26.09 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  25.33 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  25.84 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  25.85 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  25.78 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  28.22 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  22.7 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  28.64 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.79 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.08 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  26.7 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  23.74 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.57 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  26.23 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.17 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  24.21 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  23.9 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  24.88 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  25.55 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  24.88 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  23.74 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  27.36 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.71 
 
 		 258 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  25 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  30.97 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  27 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  27.32 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  27 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  23.53 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  23.53 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  27.18 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  25.58 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  26.07 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  25.85 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  22.61 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  25.94 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  26.07 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  25.23 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.62 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  23.59 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  22.03 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.67 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  25.64 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  27.6 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25.13 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25.13 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  23.31 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  27.6 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  22.66 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  21.1 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  28.5 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  25.47 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  22.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  23.04 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  23.25 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  25.37 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  22.6 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  26.04 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  24.77 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  22.13 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  24.2 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  27.32 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  22.81 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  25.13 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  22.48 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  24.19 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  22.84 
 
 		 279 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  23.91 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  26.8 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>