234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0985 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 249 aa  510  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.89 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  37.25 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.59 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  30.08 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  29.66 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  28.69 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  30.04 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  30.29 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  30.67 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  30.08 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.24 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.95 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  27.39 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.13 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  24.55 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.15 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.69 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.97 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  24.7 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  24.58 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  28.87 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  27.35 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  26.91 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  34.23 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  34.23 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  30.84 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  30.2 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.74 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  26.75 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.79 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  24.58 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  27.07 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.9 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  27.45 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  28.27 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  28.4 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  26.64 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  26.72 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  25.75 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  29.08 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  25.74 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  22.63 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  29.28 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  25.11 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  27.31 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  25.51 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  26.45 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  28.74 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  26.78 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  26.78 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  25.74 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  26.78 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  31.53 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  31.07 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  30.91 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  22.77 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.32 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  25.27 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  27.31 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  25 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>