225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0186 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  100 
 
 		 226 aa  467  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  29.15 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  31.66 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.5 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  29.15 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.74 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.82 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  28.33 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  31.54 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  29.76 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  26.42 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  27.81 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.37 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0828  putative competence protein F  28.35 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173403  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.84 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  21.66 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  26.18 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  28.5 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  27.72 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  23.3 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  31.03 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  25.96 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  23.42 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.73 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.01 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.78 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  23.26 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  26.34 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  25.13 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  22.83 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  25.53 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  24.12 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.29 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  26.7 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  24.47 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  23.98 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  21.88 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  38 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  25.58 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  22.6 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  21.58 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  25 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  27.5 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  22.22 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  27.01 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  23.27 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  36 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.53 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  23.5 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  23.5 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.49 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  23.68 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  23.59 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  22.61 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  22.28 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.49 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  30.77 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  30.34 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2568  ComF family protein  27.23 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  24.82 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  24.49 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  22.71 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  23.75 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  24.45 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  21.32 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  21.89 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  24.54 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  26.63 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  23.46 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.63 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  29.27 
 
 		 274 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  19.82 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  23.93 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  20.59 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  27.85 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  28.43 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  22.33 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  24.36 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  22.27 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  23.32 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>