210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0763 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  100 
 
 		 278 aa  517  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  43.57 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  39.66 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  44.28 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  41.09 
 
 		 202 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.92 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  40.16 
 
 		 284 aa  92.8  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  36.75 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  37.08 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  36.64 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  37.5 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  39.34 
 
 		 213 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  36.8 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.68 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  41.11 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  38.96 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  38.32 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  26.91 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  28.23 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 		 223 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  33.73 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  34.2 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.44 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  32.9 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  32.9 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  21.37 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  25.38 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  23.75 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.28 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.54 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.12 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  29.03 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.62 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.39 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.99 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  23.08 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  21.25 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.35 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.04 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.78 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  32.31 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  27.01 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  34.16 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  27.01 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  32.81 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  27.57 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  27.24 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  28.93 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  33.67 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  21.34 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.43 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  26.2 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.54 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  31.64 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  26.07 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  23.83 
 
 		 220 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  29.8 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  37.98 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.9 
 
 		 207 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  29.08 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  35.61 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  30.77 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  30.65 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  31.56 
 
 		 247 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  32.38 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  30.4 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.77 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  22.71 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  26.25 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  35.54 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  29.71 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  23.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  27.02 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  29.1 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  41.05 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>