287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4040 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 244 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  51.26 
 
 		 268 aa  131  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  44.14 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  45.64 
 
 		 284 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  44.74 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  46.09 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  30.8 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  43.58 
 
 		 202 aa  89.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.99 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  40.44 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  39.38 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  31.52 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.73 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  41.46 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  37.13 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  23.91 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25.42 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25.42 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  23.98 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  35.32 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.34 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  36.12 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.4 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  39.91 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  36.53 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.71 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  37.07 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.74 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  28.82 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  37.66 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  35 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  27.73 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  35.94 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  23.6 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  35.94 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  33.06 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.77 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  33.07 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  22.61 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  25.71 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  37.85 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  41.01 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  24.17 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  35.03 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  29.35 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  32.12 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  31.82 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.83 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  31.95 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  34.95 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  24.24 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  25.71 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.13 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  28.81 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.2 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  25.91 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.46 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  31.25 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 356 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.58 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  35.78 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  29.72 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  28.4 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  30.58 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  22.92 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  30.99 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  31.41 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  28.63 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  31.17 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  30.33 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.74 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.64 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  33.91 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>