240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7591 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  50.45 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  47.3 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  45.83 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  40.35 
 
 		 219 aa  95.1  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  37.77 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  40.16 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  36.91 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  36.91 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  37.9 
 
 		 202 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  34.82 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  39.57 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  35.68 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  39.9 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  35.65 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.79 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 308 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  33.15 
 
 		 213 aa  72  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  36.62 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  33.48 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  30.74 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  21.52 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  34.68 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  24.15 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  33.62 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  34.19 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.68 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  34.42 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  27.85 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  31.87 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  31.13 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  30.48 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29.96 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  24.68 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.68 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  25.1 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  27.8 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.41 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  31.1 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  26.48 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  40.23 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.72 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.1 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  33.17 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  29.1 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  26.91 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  22.32 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  32.81 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  42.86 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.49 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  28.95 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  32.98 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  28.38 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  24.89 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  24.89 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  30.86 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  29.82 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  27.23 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  35.14 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  29.61 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.89 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  32.7 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  24.26 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.94 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  25.44 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  30.08 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  27.95 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  21.3 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  29.82 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  33.7 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  20.44 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  26.2 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  28.18 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  28.74 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>