207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1385 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  96.57 
 
 
204 aa  354  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  96.57 
 
 
204 aa  354  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  67.61 
 
 
213 aa  237  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  65.84 
 
 
213 aa  220  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 
227 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  51.74 
 
 
222 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
268 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.39 
 
 
245 aa  93.2  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.09 
 
 
219 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
238 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  40.86 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  37.33 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  32.9 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  38.38 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  36.41 
 
 
234 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.49 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.49 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  29.19 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  27.88 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  35.44 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.49 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
259 aa  64.7  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  24.68 
 
 
297 aa  64.3  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  24.66 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  32.14 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.78 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.05 
 
 
253 aa  61.6  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
247 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  35.59 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.84 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  32.86 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25.57 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
271 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  25.96 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25.57 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  23.61 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  25.46 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
270 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
237 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  42.98 
 
 
245 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  25.63 
 
 
239 aa  58.2  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.93 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  29.57 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.9 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  30.81 
 
 
246 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  23.26 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
258 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  23.32 
 
 
230 aa  56.2  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  22.08 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  29.03 
 
 
235 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 
308 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.65 
 
 
245 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  29.29 
 
 
242 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 
279 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  26.7 
 
 
269 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  30.41 
 
 
244 aa  54.7  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 
282 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  34.02 
 
 
284 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  32.1 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  25.89 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  26.6 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  26.64 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.25 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  26.6 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  26.11 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.23 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.36 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  30.19 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.34 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  33.65 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  28.3 
 
 
262 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  25.27 
 
 
266 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  22.33 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  27.96 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 
244 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  30.14 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  27.22 
 
 
263 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
284 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  28.78 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.81 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.95 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  30.82 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  27.96 
 
 
268 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.73 
 
 
259 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>