200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3812 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  47.15 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  42.13 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  46.27 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  45.6 
 
 		 202 aa  95.1  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  39.5 
 
 		 213 aa  92  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  40 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  39.71 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  39.23 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  39.23 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  38.68 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  43.1 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  38.18 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  43.4 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  28.91 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  40.19 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  37.95 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.41 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  30.8 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  29.25 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  32.07 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.74 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.55 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  32.07 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  37.82 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  29.49 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  32.49 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  38.46 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  21.84 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  38.05 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.95 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  35.03 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.62 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  34.01 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  30.47 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  36.46 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  25.37 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  33.33 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  33.84 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  34.44 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  38.79 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.15 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  34.44 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  37.09 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  41.09 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  41.51 
 
 		 118 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  22.12 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  29.79 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.77 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.28 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  31.84 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  31.78 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  22.05 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  30.72 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  22.22 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  27.41 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.13 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  30 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  30.95 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  37.86 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  25.97 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  36.56 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  29.72 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  23.12 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  25.25 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.46 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  34.21 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  28 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  21.84 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  34.48 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  39.5 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>