212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4282 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 259 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  50.21 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  49.74 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  43.93 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  43.4 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  46.15 
 
 		 222 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  43.48 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  40.18 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  40.67 
 
 		 204 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  47.33 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  41.15 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  40.19 
 
 		 204 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  40.19 
 
 		 204 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  40.98 
 
 		 220 aa  89  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  42.64 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  40.26 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.34 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  27.8 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  26.96 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  42.47 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  41.14 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  25.3 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  30.18 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  28.51 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  40.28 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  40.19 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  35.62 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  40.47 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.53 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  31.84 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  31.84 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  37.11 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  35.35 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  33.98 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  22.65 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  22.71 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  22.71 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  27.75 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.91 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  27.67 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  34.68 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  43.68 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  38.79 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  25.65 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.61 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  25 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  30.84 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.12 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 213 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  32.5 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  38.74 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.7 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  31.9 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  33.17 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  22.65 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  34.29 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  23.93 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.45 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.64 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  32.57 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  46.27 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  31.98 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  33.33 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  31.16 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  36.63 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.42 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  30.57 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  26.79 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  30.99 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.6 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  30.94 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  29.3 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  30.94 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  27.6 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>