230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2493 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  551  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  39.43 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  41.33 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 		 244 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  42.86 
 
 		 202 aa  95.1  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 		 308 aa  92  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.14 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  37.84 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 		 227 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.47 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  41.62 
 
 		 215 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.66 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  40.27 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  39.81 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  39.61 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  39.41 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.04 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  23.77 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  23.77 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  41.8 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  38.07 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  24.8 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.9 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.52 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  39.19 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.22 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  36.65 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  34.95 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.68 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  32.34 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  23.7 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  34.47 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  34.47 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  22.27 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  30.74 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  29.61 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  35.74 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.91 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.74 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  33.33 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  33.04 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  32.91 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.48 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.39 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  35.21 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  25.33 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  35.93 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2568  ComF family protein  34.34 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  24.89 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  29.44 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.96 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.31 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  26.81 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  27.32 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  28.82 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  21.98 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  31.64 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  35.58 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  32.29 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  29.1 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  25.86 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  36.99 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  29.67 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  22.01 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  28.94 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  37.5 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.82 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.11 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  30.63 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  25.91 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  25.86 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  36.67 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.42 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  38.14 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>