103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2709 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 308 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.55 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  35.57 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  36.58 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.46 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  29.76 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.24 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  36.18 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  23.77 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  21.71 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  21.89 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  22.18 
 
 		 219 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 245 aa  52.8  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  23.46 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  33.07 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  29.32 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  24.12 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  45.07 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  27.45 
 
 		 190 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  22.13 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  25.67 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  25.89 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  29 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  25.62 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  22.39 
 
 		 231 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  24.86 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  32.39 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  25.1 
 
 		 232 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.97 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  27.76 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  21.6 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  27.73 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  21.6 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  25.58 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.07 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  28.27 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  25.43 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  26.76 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  42.31 
 
 		 238 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  25.29 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  28.33 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  21.52 
 
 		 229 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  25 
 
 		 219 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  23.69 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 		 259 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  28.63 
 
 		 204 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  28.32 
 
 		 234 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  28.41 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  22.71 
 
 		 206 aa  46.2  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 		 223 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 		 192 aa  45.8  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  18.44 
 
 		 208 aa  45.8  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  28.32 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  27 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  24.61 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  28.49 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  21.2 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  24.31 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  28.69 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  21.35 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  24.12 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  26.67 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.3 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  41.67 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  29.95 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  26.82 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  27.82 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  27.82 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.32 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0756  putative amidophosphoribosyltransferase  38.98 
 
 		 107 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  26.09 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  24.24 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  27.37 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  27.86 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 		 209 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  26.82 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>