97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1824 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 255 aa  501  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.49 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2508  competence protein F  38.43 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  36.49 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.6 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  36 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.8 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  32.28 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  29.88 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.62 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  31.74 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  28.18 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  30.77 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  22.36 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  28.9 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  24.9 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  32.16 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  23.58 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  31.84 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  31.84 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  28.07 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  21.07 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  37.36 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  30.53 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  25.13 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1243  hypothetical protein  32.98 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  26.61 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  29.19 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  23.31 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  25.63 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  21.94 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  23.73 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 180 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  29.55 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.86 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  24.89 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  25.56 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  28.69 
 
 		 342 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  25.82 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  36.73 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.25 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  28.08 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.93 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0972  comF-related protein  20.83 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.402325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  21.72 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  24.54 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  25.58 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  27.73 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  23.03 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  28.24 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  28.18 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  26.35 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  24 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  30.18 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  24 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  22.67 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  20.93 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  22.62 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  22.62 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0261  putative competence protein F  26.63 
 
 		 174 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  22.52 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  22.52 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  21.21 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  30.38 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.21 
 
 		 243 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>