142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20620 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 253 aa  484  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.6 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  35.39 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  32.71 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.17 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.8 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  34.02 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  30.77 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  36.52 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  32 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.64 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  38.12 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  24.78 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.46 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  33.33 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  25.29 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.14 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  32.46 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  23.12 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  24.84 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  23.12 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  34.31 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  24.31 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  32.05 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.74 
 
 		 180 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.28 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  27.55 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  27.23 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  23.84 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  34.94 
 
 		 299 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 185 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  24.8 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  33.19 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  29.95 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.5 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.78 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  31.73 
 
 		 189 aa  52  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.66 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  32.03 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  30.63 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  30 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  27.27 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  25.91 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  40.54 
 
 		 284 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.59 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.19 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 190 aa  49.7  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  33.01 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0828  putative competence protein F  21.13 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  34.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  22.4 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  28.21 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  30.04 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.61 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  28.7 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.33 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  28.44 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  31.2 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  31.2 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  27.33 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  29.9 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  32.77 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  29.9 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  25.89 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  31.31 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.77 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  33.82 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  41.9 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  34.09 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  32.66 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  23.61 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  32.24 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.03 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  28.76 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  21.1 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.05 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  33.91 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  31.9 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  35.09 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  32.89 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  34.23 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  29.44 
 
 		 241 aa  45.4  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  24.27 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>