130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1436 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 		 268 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  40.66 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  39.78 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  35 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  35.47 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  39.67 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  37.69 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  39.25 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  41.62 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  28.8 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  38.5 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  31.16 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25.58 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  36.72 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25.58 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  26.15 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  29.59 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.08 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.55 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  29.59 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  35.59 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  35.59 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  31.94 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  30.65 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.16 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  33.5 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  27.92 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  29.27 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  21.98 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  32.8 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  36.36 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.97 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  37.31 
 
 		 299 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  29.73 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  32.48 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  28.65 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  37.29 
 
 		 279 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  33.61 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  31.65 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  25.32 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  32.5 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  25.57 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  38.41 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  31.62 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  31.66 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  30.77 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  29.17 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  34.17 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  34.48 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  31.03 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  31.03 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  39.08 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  37.21 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  29.35 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.81 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  30.48 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  34.45 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  31.38 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  28 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.9 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 		 356 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  31.53 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.84 
 
 		 249 aa  45.4  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  31.53 
 
 		 274 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  27.59 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  29.06 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.57 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  28.04 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  29.12 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.29 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  27.53 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  32.5 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  30.32 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>