216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5842 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 356 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  47.55 
 
 		 278 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  53.99 
 
 		 238 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  40.17 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 		 244 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  41.64 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 		 227 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  43.05 
 
 		 259 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  37.59 
 
 		 244 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.64 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  38.49 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  42.63 
 
 		 202 aa  82.4  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  37.82 
 
 		 222 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.55 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  36.55 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  39.9 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  38.24 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  24.03 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.5 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  35.06 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.39 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  31.32 
 
 		 243 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  31.5 
 
 		 262 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.68 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.77 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  33.33 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.73 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  21.62 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.35 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  34.54 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  31.47 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 		 271 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  30.12 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.35 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  30.45 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  25.71 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.32 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  27.6 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  36.13 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.17 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.48 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.75 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.29 
 
 		 258 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  29.69 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  25.31 
 
 		 234 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  30.51 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.22 
 
 		 230 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  33.7 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.27 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  30.04 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  33.86 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  37.36 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  33.68 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  24.8 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  41.86 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  37.85 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  37.11 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.46 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  32.22 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  29.48 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  33.33 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  27.01 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  27.01 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  38.39 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  30.36 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  33.06 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 233 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  31.67 
 
 		 241 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  31.47 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  29.88 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  22.22 
 
 		 245 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  29.83 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  24.15 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.72 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 		 237 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  31.09 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  31.58 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.71 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 222 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>