150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1364 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 238 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  45.41 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  47.62 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  46.67 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  45 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  43.18 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  42.73 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  42.73 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  45.98 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  42.99 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  36.95 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  37.23 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  41.27 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  36.28 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.11 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  37.32 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.39 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  37.99 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.86 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.06 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.84 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  27.78 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  24.32 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  24.32 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  24.47 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  25.1 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  25.7 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  34.09 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  25.22 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.69 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  29.86 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  29.29 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  29.38 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  36.25 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  29.38 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  23.64 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  24.3 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  31.98 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2568  ComF family protein  31.9 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  33.19 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  23.38 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  28.02 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  20.81 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  37.76 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.15 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  23.71 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  24.07 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  21.61 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  27.17 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  23.21 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  31.11 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  28.63 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.74 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  30.13 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1243  hypothetical protein  37.38 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  29.51 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  29.9 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  29.33 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  43.06 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.28 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  30.73 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  34.15 
 
 		 269 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  31.21 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  27.87 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  27.14 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  33.83 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  27.4 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  27.8 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  26.85 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  29.79 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  27.5 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>