124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1079 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  50.47 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  51.39 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  48.58 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  48.58 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  48.51 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  48.61 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  48.58 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  45.36 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  42.15 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  42.58 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  40.81 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.91 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  41.43 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  38.22 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.75 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  26.89 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  39.22 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  37.93 
 
 		 278 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.16 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  39.5 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  45.55 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  23.65 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25.99 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25.99 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  39.27 
 
 		 284 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  25.82 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  22.28 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  23.15 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  23.15 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  23.58 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  32.72 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  32.39 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  32.39 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  23.15 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  24.56 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  27.22 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  24.12 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2508  competence protein F  36.82 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  26.5 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.9 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  32.39 
 
 		 253 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  30.12 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  37.43 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  33.54 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.51 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.21 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  21.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  29.26 
 
 		 246 aa  49.3  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  25.77 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  31.75 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  21.89 
 
 		 190 aa  48.9  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  33.51 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.15 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  26.72 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  30.36 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  26.18 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  27.72 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  24.76 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  27.56 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  24.2 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.89 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.75 
 
 		 258 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  29.17 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  28.44 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  22.02 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  22.09 
 
 		 245 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  28.5 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  30.22 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  24.14 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  34.57 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  32.35 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  37.29 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>