19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1143 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  61.05 
 
 		 191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  61.05 
 
 		 191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  60.53 
 
 		 191 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1469  transformation system protein  49.47 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  48.15 
 
 		 189 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  48.68 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  40.77 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1638  transformation system protein  42.02 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  38.95 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.48 
 
 		 253 aa  45.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.87 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  24.54 
 
 		 223 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  27.08 
 
 		 241 aa  41.2  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>