58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0860 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0860  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  65.96 
 
 
189 aa  255  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1469  transformation system protein  54.79 
 
 
189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  51.58 
 
 
191 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  51.58 
 
 
191 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
190 aa  185  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  51.05 
 
 
191 aa  184  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1215  transformation system protein  42.42 
 
 
233 aa  177  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0309  hypothetical protein  47.37 
 
 
190 aa  177  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1638  transformation system protein  41.49 
 
 
191 aa  149  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  21.98 
 
 
241 aa  58.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
230 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  27.72 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  29.56 
 
 
250 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  28.11 
 
 
219 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  30.39 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  42.62 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.06 
 
 
234 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  26.06 
 
 
234 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.39 
 
 
253 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  24.06 
 
 
244 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  25.74 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  32.65 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  45.45 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  45.45 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 
244 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  24.19 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  37.14 
 
 
251 aa  44.7  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  29.06 
 
 
237 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  23.04 
 
 
232 aa  44.7  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2014  hypothetical protein  60.61 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.06 
 
 
263 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  23.91 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  27.56 
 
 
269 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  48.78 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.09 
 
 
238 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  24.62 
 
 
299 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  35.29 
 
 
233 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.6 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.65 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  27.14 
 
 
233 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  28.57 
 
 
262 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  26.32 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  28.49 
 
 
241 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0756  putative amidophosphoribosyltransferase  55.26 
 
 
107 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  25 
 
 
242 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  25.57 
 
 
231 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
245 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  37.11 
 
 
118 aa  41.2  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
308 aa  40.8  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>