196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1351 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  96.57 
 
 		 204 aa  354  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  67.14 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  68.27 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  65.35 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  49.75 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 		 268 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.65 
 
 		 219 aa  87.8  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  36.44 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  31.6 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  37.84 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  30.14 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  32.65 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  34.95 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  27.88 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  30.36 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.94 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.16 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  27.65 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.16 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 		 271 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.38 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.84 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  26.51 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  26.51 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  24.36 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  25.46 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.06 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  33.98 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  23.15 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.62 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.93 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  22.5 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  24.79 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.74 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  42.11 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  32.91 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  29.57 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  34.46 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  23.32 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  29.03 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  26.7 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  30.92 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  22.79 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  24.27 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 		 282 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.25 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.23 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  33.81 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  26.71 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  27.07 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  24.27 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  29.95 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 		 308 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  23.79 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.34 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  24.14 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  30.82 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  32.99 
 
 		 284 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  31.25 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  36 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 		 284 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  27.67 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  25.38 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  28.35 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  31.66 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  23.95 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  31.71 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  27.22 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  31.45 
 
 		 262 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  27.42 
 
 		 262 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  27.96 
 
 		 268 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 244 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  22.33 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.36 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  27.51 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>