177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 299 aa  560  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.62 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  36.54 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2508  competence protein F  39.08 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  45.14 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  35.69 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  31.64 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  37.77 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  24.54 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.79 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  32.4 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.2 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  28.62 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  28.62 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  31.6 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  31.6 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  34.49 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.46 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  33.53 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  24.53 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.03 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  34.68 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.21 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.74 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.96 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  41.43 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  26.91 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  32.49 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  28.69 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  32.75 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  32.08 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  25.63 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  20.74 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  32.35 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  27.49 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  28.34 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  29.65 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  20.21 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  22.57 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  38.46 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.67 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  33.53 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  22.63 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  38.08 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  28.34 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  24.23 
 
 		 239 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  28.33 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  32.41 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  36.72 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  40 
 
 		 118 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  32.14 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  30.26 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  36.3 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  32.77 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  34.71 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  32.62 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 260 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  33.33 
 
 		 221 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  35.18 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.66 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.91 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  28.24 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  38.28 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  34.82 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  36 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  35.34 
 
 		 239 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  27.73 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  39.32 
 
 		 227 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  33.94 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  40.15 
 
 		 242 aa  49.3  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  40.15 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.36 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  24.62 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  25.2 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  36.15 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  37.6 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>