217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3630 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 227 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  54.41 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  55.35 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  54.42 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  54.42 
 
 		 204 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  50.45 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  50.25 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  52.56 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  41.75 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  48.92 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  40.27 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  37.99 
 
 		 278 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  40.89 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  40.44 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  39.67 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.78 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  37.1 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  35.86 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  37.93 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.18 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  24.89 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25.66 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25.66 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 		 308 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  34.88 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  37.12 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  26.85 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  31.25 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  29.65 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  24.37 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  33.95 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  31.25 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  29.03 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  25.4 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  29.76 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  31 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  23.92 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  38.28 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.48 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  35.09 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  26.01 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  34.55 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  31.89 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  23.25 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  32.51 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.47 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  31.85 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  27.76 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  33 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.37 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  28.92 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  23.61 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  35.53 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  28.51 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  26.29 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  32.31 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  28.21 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  30.62 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  22.22 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  32.79 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  35.35 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  32.79 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  37.38 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  27.78 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2257  amidophosphoribosyltransferase-like protein  22 
 
 		 303 aa  52.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0114297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  29.29 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 356 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  29.21 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  28.81 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  24.07 
 
 		 297 aa  52  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  22.49 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 254 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  32.52 
 
 		 299 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  35.38 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>