190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1762 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  100 
 
 
202 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
244 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  43.55 
 
 
278 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
308 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  40.66 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  39.5 
 
 
245 aa  82  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  39.72 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.78 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  30.65 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  40.66 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  38.38 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  37.84 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  37.84 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  43.43 
 
 
284 aa  71.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  33.53 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  34.73 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  40.35 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  32.77 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
253 aa  68.2  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  38.12 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  31.41 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.32 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.95 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  28 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  28 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.74 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  35.68 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.79 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  36.42 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  36.09 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  27.95 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  28.65 
 
 
255 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  34.85 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
342 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  32.69 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 
259 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  38.24 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  24.39 
 
 
245 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.17 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
269 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  22.78 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.77 
 
 
243 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.04 
 
 
253 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
279 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  34.08 
 
 
246 aa  58.5  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  29.75 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  25.15 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  29.14 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  32.73 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.48 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  30.5 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  29.59 
 
 
269 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  23.53 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  31.52 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  30.99 
 
 
251 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  34.97 
 
 
240 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  34.48 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  28.85 
 
 
231 aa  55.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.41 
 
 
239 aa  55.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  29.75 
 
 
234 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  30.6 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.3 
 
 
238 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  38.26 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  36.65 
 
 
236 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  28.25 
 
 
247 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  22.05 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  22.05 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
222 aa  55.1  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  33.33 
 
 
262 aa  54.7  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  37.43 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  30.68 
 
 
271 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
230 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
239 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  32.93 
 
 
262 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.04 
 
 
249 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
265 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  26.18 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  33.75 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  24.43 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  23.43 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.34 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  31.96 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>