262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0773 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 238 aa  427  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  62.95 
 
 		 268 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  46.44 
 
 		 278 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  48.18 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  48.2 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  47.17 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  47.71 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  43.94 
 
 		 215 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  40.09 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  43.78 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  45.91 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  43.78 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  43.78 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  45.71 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.49 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  41.75 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.7 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  44 
 
 		 342 aa  88.6  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  37.78 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  40.58 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  34.32 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  38.4 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  40.09 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  36.53 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  36.53 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.04 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  40.45 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  45.04 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.91 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  25.64 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.25 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  33.19 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  26.38 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  41.47 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  31.22 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.46 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  33.96 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.56 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  25.65 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  33.68 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.58 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  35.96 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.22 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.3 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  38.55 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  22.07 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  25.89 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.32 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  22.97 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.54 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  34.06 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.92 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  33.92 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.34 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  29.88 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  35.81 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  35.45 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  32.44 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.39 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.16 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  32 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  23.21 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  23.21 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  24.34 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.87 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  29.79 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  23.22 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  23.22 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  34.55 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  22.5 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  40 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  28.57 
 
 		 221 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  31.55 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  37.43 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  27.4 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  30.29 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  30.73 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>