143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6307 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 206 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  47.03 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  43.14 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  40.08 
 
 		 278 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  39.91 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  43.94 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  39.9 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  39.42 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  39.42 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  45.65 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  41.55 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.38 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  24.19 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.93 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  37.84 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  37.2 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  38.14 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  45.26 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  29.35 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.02 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.02 
 
 		 263 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  28.21 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  36.96 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  23.86 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.63 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  26.58 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  33.94 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  23.23 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  23.9 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  34.46 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  29.79 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  27.33 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  32.39 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  23.79 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  23.79 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.14 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  37.63 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.65 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.13 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  38.06 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  40.1 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  33.78 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  28.93 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  30.35 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  41.61 
 
 		 356 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  26.29 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  24.31 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  24.41 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.37 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.7 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  24.32 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  38.41 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.82 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  30.96 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  32.29 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  21.76 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  30.32 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  29.65 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  27.37 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  32.17 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  23.5 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 272 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  21.83 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  21.83 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.05 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 		 342 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.63 
 
 		 258 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 308 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  24.03 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  33.73 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  24.75 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  29.86 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  29.47 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  25.12 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  31.76 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  26.05 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.66 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>