200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1760 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  75.59 
 
 
208 aa  255  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  67.61 
 
 
204 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  67.14 
 
 
204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  67.14 
 
 
204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  62.75 
 
 
213 aa  226  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  50 
 
 
222 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  38.53 
 
 
278 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.96 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
268 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
238 aa  94.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
245 aa  92  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.33 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
238 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  37.21 
 
 
244 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  36.76 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  39.09 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  39.42 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  32 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.33 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.33 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  36.77 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  37.26 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.72 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  39.48 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  32.63 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
247 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  25.58 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.56 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  24.77 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  39.49 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.22 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.32 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  25.57 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  36.05 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25.78 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25.78 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  23.33 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  23.31 
 
 
297 aa  62  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  27.4 
 
 
255 aa  62  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
239 aa  61.6  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  27.31 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.81 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  30.56 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.81 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.2 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  27.13 
 
 
308 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  30.5 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  42.98 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  31.2 
 
 
262 aa  58.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  30.19 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
246 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  24.24 
 
 
226 aa  58.5  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  32.62 
 
 
262 aa  58.2  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  27.9 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  29.21 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
279 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  34.73 
 
 
233 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  29.15 
 
 
263 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.3 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 
279 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  31.15 
 
 
255 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  32.03 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  31.36 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2257  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.64 
 
 
303 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0114297  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
272 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  32.62 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.36 
 
 
249 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  33.19 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  31.79 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  32.68 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  30.1 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  32.68 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.76 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  28.27 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  28.71 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  34.34 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  28.38 
 
 
246 aa  52.4  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  35.29 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  27.54 
 
 
252 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.22 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>