159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13271 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  411  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  64.95 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  64.49 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  64.49 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  62.96 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  61.68 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  48.51 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  41.43 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.71 
 
 		 245 aa  98.2  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  36.44 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  44.09 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  37 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 		 268 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  39.11 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.07 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  39.11 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.8 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  28.7 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  40.09 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  37.79 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  38.16 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  25.83 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  33.18 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  28.38 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  31.58 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  30.09 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.09 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  24.2 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  26.09 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.79 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  23.76 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  34.38 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.3 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.22 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  25.13 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  20.34 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  24.3 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  21.37 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  28.64 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  26.27 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  26.27 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  30.36 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  29.52 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  40.19 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.31 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  26.63 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  27.92 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.34 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  36.2 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 356 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  42.67 
 
 		 284 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  25.36 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.44 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  24.24 
 
 		 266 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  38.74 
 
 		 118 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  23.63 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  26.76 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  27.07 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  28.09 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  28 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  38.98 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  26.47 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  30.23 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  24.12 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  28 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  26.07 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  22.37 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  35.71 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  27.08 
 
 		 262 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.27 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 		 271 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 		 279 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  38.1 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  24.88 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  24.88 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  23.18 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  27.08 
 
 		 268 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>