139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0970 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  87.73 
 
 		 220 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  45.92 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  47.71 
 
 		 238 aa  91.7  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  39.27 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  37.86 
 
 		 278 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  40.57 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  36.73 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  38.29 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  41.21 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  25.58 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  39.32 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  38.49 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  27.14 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.22 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.71 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  39.51 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  36.03 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0088  hypothetical protein  22.78 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0780431  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  37.38 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  37.38 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  24.79 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.43 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  26.36 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  40.18 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  32.11 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.99 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  31 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.45 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.99 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  25.11 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  20.98 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.44 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  27.01 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  33.73 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  33 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  24.19 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  31.96 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  24.19 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  34.12 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  28.39 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  34.35 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26.78 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  27.94 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  23.05 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  21.29 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  31.03 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  30.66 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  29.66 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  23.27 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  30.1 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  25.12 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  20.95 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  30.64 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  28.18 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  28.02 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.03 
 
 		 255 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.06 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  26.55 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  33.33 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  26.06 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  23.92 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  30.1 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  25 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  32.7 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  37.04 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  28.92 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.47 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.07 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  25.23 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  26.29 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  27.45 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>