239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0088 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0780431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  24.88 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  27.03 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  25.11 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 		 276 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  27.96 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  28.72 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  23.18 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  24.76 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  24.75 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  23.93 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  22.94 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  29.08 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  24.03 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  22.17 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  25.58 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  25.48 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  36 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.85 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  26.63 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  23 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  26.49 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  25.24 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  23.68 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  22.75 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  27.72 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.89 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  24.74 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  24.77 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  25.73 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.19 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  28.05 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  26.67 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  31.36 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.77 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  22.75 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  27.35 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  22.22 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  24.89 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  24.48 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  22.81 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.74 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  26.24 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  22.94 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  24.06 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  25.82 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  25.57 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  25.69 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  26.24 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  25.39 
 
 		 299 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  25.71 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  24.02 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  30.25 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  24.49 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  22.69 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  26.83 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  25.65 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  25.23 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  22.62 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  24.46 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  25.13 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  25.23 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.24 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  22.09 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  27.12 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  26.11 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  25.66 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  25.82 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  27.12 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  28.1 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  21.99 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  24.37 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  21.72 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  23.15 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  23.72 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  25 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  23.6 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>