72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0595 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  613  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  25.9 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  24.55 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  23.95 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  23.17 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  22.45 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  25.68 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  23.77 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  26.01 
 
 		 219 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  24.26 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  26.18 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  26.18 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  23.11 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  24.62 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  25.19 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  21.51 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.68 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  24.55 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  24.68 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  22.59 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  24.55 
 
 		 245 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  22.54 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  22.43 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  24.55 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  25.76 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  25.41 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  23.55 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  25.65 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  23.69 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  22.78 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  24.36 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  24.36 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  23.67 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  24.05 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  24.47 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.48 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  23.01 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  21.65 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  22.95 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  23.38 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  24.48 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  21.66 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  26.24 
 
 		 233 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  23.88 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  22.4 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1458  transformation system protein  37.88 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.476694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  23.33 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  21.33 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  22.77 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  23.02 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  22.84 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  24.09 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  21.35 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  21.15 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  23.3 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  22.47 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  23.73 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  21.61 
 
 		 213 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  24 
 
 		 234 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  23.18 
 
 		 219 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  23.67 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  27.83 
 
 		 226 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  22.94 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  22.75 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  23.91 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  24.15 
 
 		 247 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  22.67 
 
 		 244 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  31.9 
 
 		 231 aa  42.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>