82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3741 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 342 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  48.78 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 219 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  35.05 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  36.16 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  36.16 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  37.13 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 282 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  36.56 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  37.04 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  39.2 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  27.4 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  23.77 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  23.77 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  37.99 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  34.38 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  35.29 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  25.88 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  34.86 
 
 		 202 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  25.32 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  34.91 
 
 		 207 aa  53.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  25.33 
 
 		 229 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  29.96 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  33.19 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  33.14 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.39 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  25.5 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  24.53 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  27.78 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  31.34 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  29.36 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.67 
 
 		 236 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.52 
 
 		 206 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 264 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  31.64 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.64 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  31.51 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  25.68 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  47.46 
 
 		 195 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.35 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  31.95 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.81 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  34.25 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 246 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  30.52 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  32.91 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  33.72 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  33.5 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  40.3 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  34.44 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 192 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 		 213 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  28.98 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  26.82 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  44.87 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  38.81 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  31.92 
 
 		 242 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 193 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  27.73 
 
 		 263 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  27.73 
 
 		 237 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.94 
 
 		 233 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  30 
 
 		 230 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>