More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0506 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  68.91 
 
 
193 aa  262  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
192 aa  259  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  61.98 
 
 
192 aa  249  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  38.59 
 
 
479 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  38.59 
 
 
479 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  36.79 
 
 
195 aa  121  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  37.1 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.92 
 
 
451 aa  119  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  35.52 
 
 
477 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.86 
 
 
500 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  47.29 
 
 
221 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
166 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
181 aa  106  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
213 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 
182 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
201 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
215 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
212 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 
169 aa  101  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  42.36 
 
 
207 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
229 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 
211 aa  99  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  31.09 
 
 
474 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 
232 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
186 aa  95.1  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
219 aa  95.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  36.63 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 
215 aa  93.6  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
215 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
209 aa  94  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
217 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1001  orotate phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
234 aa  92.8  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  34.32 
 
 
170 aa  92.8  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
174 aa  92.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90848  orotate phosphoribosyltransferase  29.67 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2669  orotate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
209 aa  91.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
217 aa  90.9  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  32.72 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
239 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
219 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  32.72 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  34.88 
 
 
210 aa  89  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
210 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
175 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
210 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2181  orotate phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134132  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05884  orotate phosphoribosyltransferase (Eurofung)  31.53 
 
 
241 aa  87.8  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 
176 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
233 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0528  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
230 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  29.67 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
192 aa  84.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
191 aa  84.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
176 aa  84.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
237 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  31.22 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1929  orotate phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0430613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>