178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4707 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  400  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  75.59 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  68.27 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  68.27 
 
 		 204 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  68.27 
 
 		 204 aa  237  8e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  61.88 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  49.75 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.97 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  41.2 
 
 		 268 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  42.78 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  38.92 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  34.04 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  35.94 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  33.78 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  31.98 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  31.98 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.68 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.58 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  27.83 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  26.82 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  36.16 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  37.04 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  27.4 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  35.92 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.39 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  33.55 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.05 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  34.44 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  31.74 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  30.62 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  24.15 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  24.63 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  24.62 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  34.73 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0760  transformation system protein  26.21 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00157325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  27.03 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  31.09 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  26.87 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  23.18 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  31.93 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.27 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  28.43 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  32.45 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1172  transformation system protein  25.24 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.363092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1047  transformation system protein  25.24 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.733048  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  31.49 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  21.5 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  27.97 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  37.34 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  27.31 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.17 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  39.23 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  28.99 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  21.65 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  29.9 
 
 		 263 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  32.67 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  31.76 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  24.47 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  32.89 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  24.2 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.81 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  31.82 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  29.9 
 
 		 263 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.72 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  29.13 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  39.13 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  22.27 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  26.79 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1143  conserved hypothetical protein, possible purine/pyrimidine phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0756  putative amidophosphoribosyltransferase  49.21 
 
 		 107 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  31.33 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>