190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0972 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0972  comF-related protein  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.402325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  27.32 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.97 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  27.48 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  26.64 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.19 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  25.91 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  29.17 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  26.55 
 
 		 226 aa  72  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  25.29 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  27.65 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.33 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.54 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  23.83 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.53 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  24.45 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  25.09 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  27.19 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.82 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  24.31 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0828  putative competence protein F  25 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  26.82 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  22.48 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  23.83 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  22.48 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  24.77 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  25.99 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  23.91 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  23.77 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  24.31 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  23.68 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  23.67 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  21.54 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  30.97 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  24.15 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  25.57 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  24.73 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  25.28 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  22.87 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  23.31 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  25.28 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  25.38 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  26.34 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.89 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2568  ComF family protein  28.85 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  27.16 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  30.36 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.73 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  29.59 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  25 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  33 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  28.14 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  24.3 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  25 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  23.56 
 
 		 230 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  24.88 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  24.19 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  23.51 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  27.74 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  24.34 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.62 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  29.36 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  28.71 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  25.22 
 
 		 206 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  22.57 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  24.05 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  27.19 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  22.3 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  22.38 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 247 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  26.25 
 
 		 230 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  26.06 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  31.78 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  25.56 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0261  putative competence protein F  30.48 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.460395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  25 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  28.24 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  29.82 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  27.56 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  23.57 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  26.55 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.65 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  25.4 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  32.17 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  22.31 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  25.54 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  28.07 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  28.32 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  24.32 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>