More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1381 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  53.44 
 
 
190 aa  207  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
201 aa  206  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  53.11 
 
 
191 aa  197  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  50.8 
 
 
191 aa  192  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
187 aa  191  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
187 aa  191  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  46.77 
 
 
193 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
195 aa  188  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  48.09 
 
 
190 aa  188  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
193 aa  188  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
191 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 
188 aa  184  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
188 aa  182  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  45.65 
 
 
189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  50.27 
 
 
196 aa  179  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
193 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  45.65 
 
 
193 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
196 aa  179  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
195 aa  177  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 
191 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
188 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
195 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 
189 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
196 aa  168  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  45.21 
 
 
195 aa  168  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
196 aa  167  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  43.94 
 
 
202 aa  164  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  44.27 
 
 
200 aa  159  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
202 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
202 aa  157  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  44.09 
 
 
194 aa  157  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 
202 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
202 aa  155  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 
202 aa  154  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
183 aa  153  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
206 aa  153  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
192 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
192 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
202 aa  152  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 
198 aa  151  7e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
194 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 
202 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  42.55 
 
 
192 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  41.49 
 
 
192 aa  147  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  42.08 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 
190 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 
196 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
187 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 
196 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  41.81 
 
 
195 aa  141  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  41.8 
 
 
202 aa  140  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
196 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
216 aa  95.5  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.3 
 
 
479 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.3 
 
 
479 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.77 
 
 
482 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  27.67 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
215 aa  62  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  28.05 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>