202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3874 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  72.4 
 
 		 194 aa  278  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  67.86 
 
 		 196 aa  241  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  58.12 
 
 		 194 aa  214  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  58.12 
 
 		 194 aa  210  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  54.45 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  54.4 
 
 		 196 aa  201  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  54.92 
 
 		 196 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  51.56 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  51.56 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  48.4 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 192 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  49.45 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  43.39 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  44.62 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  48.88 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  48.88 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  42.49 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  43.81 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  41.53 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 202 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  38.27 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 		 183 aa  131  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 187 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  25.75 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  27.38 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  28.05 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  27.57 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  26.22 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>