204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0653 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  97.4 
 
 
192 aa  377  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  72.92 
 
 
192 aa  287  7e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 
194 aa  244  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  60.62 
 
 
194 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  62.18 
 
 
194 aa  230  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  59.28 
 
 
196 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 
196 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 
196 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  57.73 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  57.29 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
196 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
201 aa  160  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
190 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 
191 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
192 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
192 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 
190 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 
191 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  41.05 
 
 
191 aa  149  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 
200 aa  148  4e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
195 aa  147  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
187 aa  144  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
187 aa  144  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
199 aa  142  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  39.06 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
193 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
188 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
193 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
199 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  42.02 
 
 
189 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  38.17 
 
 
206 aa  124  9e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 
189 aa  123  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
188 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
195 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 
195 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
187 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  36 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  38.34 
 
 
189 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 
202 aa  111  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  37 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 
202 aa  105  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  34 
 
 
202 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
202 aa  104  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  34 
 
 
202 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
202 aa  102  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
202 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  29.12 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  24.82 
 
 
221 aa  58.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  25.43 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  24.7 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
166 aa  54.7  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1987  orotate phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0105796  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
185 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  23.91 
 
 
500 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2007  orotate phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
213 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  21.15 
 
 
210 aa  49.7  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03730  orotidine monophosphate pyrophosphorylase (URA5)  27.33 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  23.65 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>