161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1780 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
202 aa  408  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  80.69 
 
 
202 aa  335  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  79.21 
 
 
202 aa  332  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  78.22 
 
 
202 aa  329  1e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  75.25 
 
 
202 aa  311  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  75.25 
 
 
202 aa  310  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  76.24 
 
 
202 aa  311  5.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  74.75 
 
 
202 aa  308  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  64.85 
 
 
202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  61.88 
 
 
202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  49 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
188 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
190 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 
192 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 
192 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
195 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  44.27 
 
 
189 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
191 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 
193 aa  147  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  43 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 
193 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  39.8 
 
 
193 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
190 aa  141  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
191 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
193 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 
191 aa  138  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 
199 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 
187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 
187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  38.31 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  37.24 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  37.69 
 
 
196 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 
196 aa  123  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 
196 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
200 aa  116  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 
198 aa  116  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
187 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
206 aa  108  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
195 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 
189 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
194 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
192 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
192 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
192 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
190 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
192 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
194 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 
192 aa  87  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  26.73 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
173 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  27.38 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3734  hypothetical protein  26.9 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
191 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
215 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  28.73 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
171 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1353  orotate phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
202 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 
175 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2288  Adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
171 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.25421  hitchhiker  0.000000391935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 
233 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>