234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1732 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
194 aa  391  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  65.8 
 
 
194 aa  253  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  65.28 
 
 
194 aa  249  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  61.86 
 
 
196 aa  247  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  62.18 
 
 
196 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  61.78 
 
 
196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  60.62 
 
 
196 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 
196 aa  236  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  62.18 
 
 
192 aa  230  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  62.18 
 
 
192 aa  230  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  61.14 
 
 
192 aa  228  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  54.4 
 
 
192 aa  206  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  57.07 
 
 
194 aa  201  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  58.12 
 
 
196 aa  195  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  53.65 
 
 
196 aa  180  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
190 aa  168  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 
198 aa  159  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 
196 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
193 aa  154  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 
199 aa  154  8e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 
200 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 
201 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  40.53 
 
 
191 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
190 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
192 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
192 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 
193 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
187 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  45.41 
 
 
187 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
193 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
193 aa  148  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 
191 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
195 aa  148  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 
199 aa  144  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  40.84 
 
 
191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 
195 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
206 aa  142  4e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
188 aa  141  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
189 aa  141  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
189 aa  141  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 
188 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 
189 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  39.55 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 
196 aa  127  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
183 aa  124  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
187 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
187 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 
190 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
187 aa  121  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
202 aa  118  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 
202 aa  114  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  34.54 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 
196 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  35.18 
 
 
202 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 
202 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
202 aa  101  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  31.35 
 
 
192 aa  101  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
202 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
214 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
207 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
201 aa  54.7  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
181 aa  54.7  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0195  orotate phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>