42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3734 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3734  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  26.18 
 
 
193 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
191 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 
202 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  23.83 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
195 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  24.48 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  33.86 
 
 
191 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  25.74 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  24.61 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  26.04 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  27.37 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  25.51 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  22.92 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
189 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  23.59 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
202 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  25.87 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  27.14 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  27.13 
 
 
191 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  27.37 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  27.51 
 
 
187 aa  45.1  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  25.58 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
190 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
191 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>