More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1277 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  62.11 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  56.84 
 
 		 191 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  56.61 
 
 		 191 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  52.75 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  56.04 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  54.4 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  53.68 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  56.04 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  56.35 
 
 		 188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 193 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  55.26 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  49.74 
 
 		 190 aa  210  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 		 191 aa  208  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 189 aa  201  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  52.75 
 
 		 195 aa  201  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 		 196 aa  182  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  45.3 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 		 187 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  47.28 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  44.92 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 		 202 aa  150  8.999999999999999e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 		 196 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 		 202 aa  140  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  41.81 
 
 		 196 aa  137  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  47.52 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  34.85 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 		 216 aa  98.2  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0921  orotate phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  34.11 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0528  orotate phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.560571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>