More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2348 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  73.02 
 
 
191 aa  277  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  60.64 
 
 
201 aa  244  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  56.84 
 
 
191 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  59.26 
 
 
190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
190 aa  241  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 
193 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  55.79 
 
 
193 aa  233  9e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
188 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 
187 aa  222  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 
187 aa  222  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  53.72 
 
 
193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
188 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
193 aa  209  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
193 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
195 aa  203  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
189 aa  202  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  55.85 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
195 aa  189  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
192 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
192 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  51.89 
 
 
196 aa  178  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
195 aa  178  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 
196 aa  177  8e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  48.92 
 
 
189 aa  174  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
188 aa  174  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  44.92 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  46.23 
 
 
202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
187 aa  171  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 
187 aa  169  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
187 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
196 aa  168  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  47.15 
 
 
194 aa  166  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
192 aa  162  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 
183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  46.77 
 
 
189 aa  161  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  43.22 
 
 
202 aa  159  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
195 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 
202 aa  159  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
202 aa  158  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 
202 aa  157  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
202 aa  155  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
202 aa  154  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  44.22 
 
 
202 aa  153  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  43.88 
 
 
202 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  42.49 
 
 
199 aa  152  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 
192 aa  150  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  42.19 
 
 
192 aa  150  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 
192 aa  150  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
198 aa  150  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 
194 aa  148  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
202 aa  148  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
194 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
196 aa  147  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
196 aa  147  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
206 aa  143  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
196 aa  143  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  41.27 
 
 
200 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  41.45 
 
 
196 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  38.74 
 
 
194 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  40.84 
 
 
196 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 
199 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
216 aa  91.3  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  34.73 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  30 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  31.39 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>