179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3194 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  98.98 
 
 		 196 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  96.94 
 
 		 196 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  77.2 
 
 		 196 aa  300  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  76.04 
 
 		 196 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  60.62 
 
 		 194 aa  239  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  60.31 
 
 		 194 aa  230  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  58.25 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  57.73 
 
 		 192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 196 aa  184  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  50.77 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  48.13 
 
 		 189 aa  168  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 190 aa  158  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  45.13 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  39.27 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  42.93 
 
 		 196 aa  151  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  42.63 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  39.38 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  42.63 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  37.69 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  40.93 
 
 		 191 aa  140  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 189 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 		 195 aa  138  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  37.31 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  39.04 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  38.81 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 		 202 aa  120  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  38.27 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  31.45 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  23.72 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  23.08 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  22.44 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  29.85 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  29.03 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0921  orotate phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  24.49 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  26 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>